内容が不明なのですが、、、。auto entrepreneur (今はMicro entrepreneurに統一されています）のcotisationの支払いは義務です。2年間déclarationがありませんと、資格およびSiretは失効となります。登録から2年以上経過していれば、資格は喪失されていると思います。
フリーランスと一言で言っても色々な形があります。アーティスト系の方などurssafへdéclarationしない形態の方もいらっしゃいますので、確定申告で今まで判明していなかったのかもしれません。A(M)Eは所得税以外にも支払うべきものはありますし、支払い期限を過ぎると罰金が生じます。
一度も支払わず、更に資格失効後にも活動を続けていたとなると、かなりの罰則がかかると思います。

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