あああああさん、ありがとうございます！
問い合わせをしました。購入した帰りの日程がすでに混んでいて、費用がかなり上がるとのことで、帰り便を変更することで解決しました。余談ですが、JALヨーロッパ予約センターはつながりづらかったですが、対応は親切でした。

kotoさん、JALご経験の共有をありがとうございました。上記に書いたとおりの結末です。
いずれもjalのセンターへ聞くのがよいことがわかり、助かりました。
ジモモの回答者さんへのお礼コメントの書き方がよくわからず、こちらに記載しました

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夫婦でJALを利用して年末年始に一時帰国した際、ネットで二人分のチケットを購入したにもかかわらず、帰り便は隣同士の席がたとえ有料でも予約出来なかった経験を持つ者です。出発前にヨーロッパ予約センターに問い合わせたところ、いったん帰国してから、JALの空港カウンターで聞いてみるのが一番確実だと言われたのですが、実際には日本滞在期間中、日本のJAL国際便コールセンターに電話をして隣同士の席を確保することが出来ました。帰国されたらなるべく早めに日本のコールセンターに電話されるのが確実かと思われます。ご参考になれば幸いです。

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別々に買った事がないですけれど、席の指定ができなかった事があり空港のカウンターで親子3人での旅行である事を告げたら、並びにしてもらえました。
秋でまだ先ですから満席ではないでしょう。電話をして事情を伝えてみては？
昨年、JALヨーロッパ予約センターに質問・変更で電話をした際（日本語OK）、日本人スタッフが非常に親切に対応してくれました。サイトだといくら見てもわからないかもしれませんから、電話してみるのをおすすめします。

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