私の経験から。2023年7月に滞在許可証申請しました。その時にアカウント作成しているので、申請済みの顔つきの書類は獲得。結婚40年以上、フランス国籍の子供3人、持ち家なので、すぐにもらえると思ってましたが、何か月経っても進展なし。その間、いつもらえるかわからないので、時間だけが過ぎて、出国もせず、2024年11月に在日フランス大使館でビザを取得しようと思い、帰国しました。出国の際に税関のお姉さんに滞在が1年以上過ぎていると指摘され（2023年11月に一度、帰国しています）、滞在許可証を申請しているという紙を見せて、1年半近く待っているけれど音沙汰がないので帰国してフランス大使館にビザ申請に行きますと伝えました。納得がいかない様子でしたが、何も言えないのか、パスポート投げつけられました…東京のフランス大使館に相談したところ、「再入国ビザ」申請が必要と言われましたが、結局のところ、大使館も管轄のprefectureに聞いてみないといつになるかわからないと言われ、その上、パスポートを大使館に預けなければいけないので、何も申請しませんでした。その日本滞在中の12月12日に「滞在許可証取得の許可がおりました。許可証を作成中です。次のお知らせまでこの証明書をお持ち下さい」とメールが届きました。フランス入国の際に必要かと思い、パスポートと持っておりましたが、税関からは何も求められず入国。1月半ばにやっと、メールではなく、SMSで準備ができたと連絡が入り、やっと取得できました。許可から1か月経っておりましたが、発行日は12月12日。1年間有効。最初の申請に50€。取得に425€でした。申請から1年半かかりました。日本で長く滞在されるのであれば、再入国ビザ申請されるのがいいとは思いますが。領事館で予約必要です。特に親身になって対応して頂けませんでした。以上。

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＞滞在許可証初回申請中ですが、取得できていません。レセピセも受け取っていません。

この場合、フランスから出国はできますが、通常フランスへの再入国はできません。
滞在許可証初回申請中は、原則として「（フランスに滞在し続けたいなら）フランスから出国すべきではない」とされているため、たとえレセピセがあったとしても再入国はできません。
あああああさんがおっしゃるとおり、日本から出発の際、フランス行きの飛行機に搭乗できるかどうかも怪しいです。

どうしても帰国しなくてはならない場合、申請中の滞在許可証は諦めて、日本で一からビザを取り直し、再度滞在許可証を申請することになりますが、申請半ばで帰国した件がどう影響するかはわかりません。

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考えられる最悪のパターンだけ。
フランス出国は自由（でていくのはご自由にどうぞ）。
日本出国時、日本帰国のチケットがなく有効期限内の滞在許可証（やレセピセ）がなければ搭乗拒否される可能性あり。私は毎回、フランスに帰国する際日本の空港で提示を求められます。直行便ではなく欧州の別の国経由の場合も、そこで提示を求められます。それらをスルーし、フランスへついた場合。入国審査で提示を求められ、ないばあい。今までの滞在許可申請までの数年とお金がゼロになり、何日以内に帰国せよと命令がでるかもしれず、その場合日本へ帰国しビザの申請からやりなおし。

ということが考えられます。
大丈夫だったよ、という人もいるでしょう。があなたも絶対に大丈夫という保証はどこにもありません。
帰国せねばならない内容が、人道的な問題である（親が危篤だの？）とか裁判所の出頭命令があるだのの場合は何かしらあるのかもしれません。
そういう場合デリケートな問題ですし、ご自分で県庁、ANTS、在仏日本大使館、在日仏大使館、弁護士に相談をしてみてはいかがでしょうか。

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