元々、昨年11月に発表されたことですが、今年の夏から外国人の就労目的のための滞在許可の発給数が制限される事が決まっています。そのため今までより厳しく細かく審査されるのかもしれません。
https://info.ensemblefr.com/news-508.html
また新体制により部門の縮小や、コロナ禍により手続きが以前より時間がかかることは十分考えられます。

私の認識では、書類を提出するときに残りの滞在期限が最低3ヶ月、だと思っていました。書類リストが送られてくる時点ではあくまで問い合わせであって、申請ではないと思います。申請書類リストなんかは通常時、プレフェクチュールへ直接出向いても貰えるものです。（ただ、今はコロナ禍でRDVがないと入れてくれないかもしれません）
本来は大体申請（すべての書類を提出）から2週間ほどでメール返信が来ますが、今はプレフェクチュールの業務がかなり滞っていますので、かなり時間はかかると思います、、、。
書類は書留で送られていて、追跡で届いているのもご確認されていますよね？問い合わせもして待つしかないと言われれば、それならやはり待つしかないのではないかと思います。
もし、提出した書類に不備や追加書類提出要請があれば、メールが来ると思います。私は別の身分ですが、メールで追加書類の提出を求められました。

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申請時に滞在期限が3ヶ月以上残っていることが最低条件のようです。

https://www.nes-global.com/blog/2019/03/23/留学後に現地で働きたい！フランス留学後に就職/

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